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Binding

基于片段的药物发现的化学位移扰动分析

Mnova Binding可以用于基于片段的药物发现的化学位移扰动分析,是一个强大的工具,可以自动处理2D HSQC实验的蛋白质配体滴定谱图,跟踪峰值移动并计算多个峰值的Kd。

对多个峰的Kd进行统计分析,还可以将测量的CSP提交给第三方软件(AFFINImeter),以便使用不同的结合模型对结合等温线进行高级分析。

 

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对1D和2D NMR滴定进行化学位移扰动 (CSP) 分析

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亮点

Mnova使RM数据的分析变得简单,为分析可能有些棘手的数据提供了一套先进的软件解决方案。

直观的工作流程,可让您以交互方式或全自动方式分析CSP滴定谱图。

自动对峰值移动进行跟踪、测量化学位移扰动 (CSP),将其与配体浓度相匹配以计算Kd。

校正拥挤谱图区域中的自动峰值移动跟踪。

提供用于处理和堆叠多个2D HSQC谱图的工具,以不同的颜色显示它们。

轻松导出CSP值,以进一步研究配体-蛋白质结合模型。

Mnova Binding包含用于NMR的AFFINImeter的免费1年的使用权

用于核磁共振的AFFINImeter允许对来自2D NMR滴定的结合等温线进行高级分析,以测量结合常数 (KA)。结合等温线直接从软件Mnova导入,AFFINImeter-NMR中提供了一系列高级工具,以充分利用NMR数据,包括:

结合等温线的全局分析

使用复杂的Binding模型进行分析

先进的算法保证收敛避免局部最小值,以及评估参数的不确定性、拟合优度和结果可靠性

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特征

谱峰跟踪:

自动跟踪和测量具有CSP的HSQC叠加谱图。左图显示了两个归属谱峰的移动。右侧显示了其中一个跟踪峰“13C-H”的详细信息,包括配体/蛋白质的浓度比、任意维度的CSP测量值、归一化CSP以及Kd的拟合结果和误差。。

测量&拟合:

化学位移扰动的常规选项卡显示了滴定光谱、蛋白质浓度、配体浓度以及配体与蛋白质浓度比的配色方案列表。

它还显示了所有分析峰的CSP测量和Kd拟合列表,以及Kd的平均值和标准误差。

全自动分析:

只需在“titration file”中按顺序列出滴定系列即可。所用配体的名称编码在“ligands file”中。当CSP自动运行分析时,它会为“titration file”中列出的每个滴定创建不同的Mnova文件,并且Mnova文件根据配体的名称进行命名。。

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市场(学术、政府&工业)

  •      ✯ 在基于片段的药物发现、SAR-by-NMR 和配体-蛋白质结合           筛选领域工作的NMR专家和药物化学家
  •      ✯ 使用滴定核磁共振方法进行一般蛋白质-蛋白质、蛋白质-配           体相互作用研究的研究人员

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